Η Διεύθυνση Ναυτικού Χημείου έχει αρμοδιότητα σε θέματα:
α. Διεξαγωγής γενικών και ειδικών χημικών ελέγχων και αναλύσεων των πάσης φύσης υλικών του Π.Ν, πλην των καυσίμων, των λιπαντικών και των τροφίμων.
β. Εκτέλεσης φυσικοχημικών και δυναμομετρικών ελέγχων των πάσης φύσης και προέλευσης υλικών, τα οποία παραλαμβάνονται από το Π.Ν, πλην των καυσίμων, των λιπαντικών και των τροφίμων.
γ. Ελέγχου των δεξαμενών καυσίμων και λοιπών χώρων για τυχόν ανίχνευση εκρηκτικών αερίων.
δ. Εκτέλεσης φυσικοχημικών μελετών, με σκοπό τη συμπλήρωση και ενημέρωση των προδιαγραφών υλικών του Π.Ν.
ε. Παροχής συνδρομής στα Πολεμικά Πλοία και στις Ναυτικές Υπηρεσίες, προς επίλυση της χημικοτεχνικής φύσης ζητημάτων.
στ. Συνεργασίας και συμμετοχής σε ερευνητικά προγράμματα άλλων φορέων.
